Variants du Coronavirus : le variant Delta et l'impact futur des mutations virales

Si vous êtes entièrement vacciné, faut-il vous inquiéter de l'impact des variants de la COVID-19 ? Non, en fait les vaccins ont fait la preuve de leur efficacité pour prévenir les hospitalisations et les décès liés à ces variants du SARS-CoV-2. Même si le tristement célèbre variant Delta a maintenant été détecté dans 98 pays et dans les 50 États américains, 99 % de l'ensemble des cas de décès et d'hospitalisation liés à la COVID-19 concernent des personnes non vaccinées, selon une étude récente analysant les données gouvernementales.  

Qu'en est-il des autres variants ? En juin 2021, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a mis en place une stratégie de désignation qui utilise la nomenclature de l'alphabet grec (Alpha, Bêta, Gamma, etc.) pour simplifier la discussion au sujet des variants du SARS-CoV-2 auprès des populations non scientifiques. Cet article récapitule les attributs de ces variants et leur impact futur sur notre santé mondiale.

Classement des variants du SARS-CoV-2

Un groupe inter-agences du gouvernement américain a développé un système de classement à trois niveaux pour les variants du SARS-CoV-2 :

• Variants à haut risque
• Variants préoccupants
• Variants d'intérêt

Aucun variant ne se situe actuellement au niveau supérieur des variants à haut risque. Ce niveau supérieur, le plus critique pour les variants, est défini par une non-détection par les diagnostics, une susceptibilité nettement réduite aux vaccins ou autres traitements et plus de cas de maladie clinique grave (c'est-à-dire d'hospitalisations) que dans les niveaux inférieurs. Le niveau le plus bas, Variants d'intérêt, contient des variants qui présentent des marqueurs génétiques affectant la transmission virale et l'évasion immunitaire. Ces variants d'intérêt sont souvent responsables d'infections de clusters démographiques. Les variants Eta et Iota se situent actuellement à ce niveau et justifient une surveillance. Les autres variants d'intérêt sont les variants Zeta, Theta, Kappa et Lambda.

Le niveau intermédiaire, étiqueté Variants préoccupants, contient les variants couramment évoqués dans les médias. Outre les critères qui s'appliquent aux variants d'intérêt, les variants préoccupants présentent une protection vaccinale réduite, une neutralisation nettement réduite par les anticorps, une transmissibilité accrue et une augmentation de la gravité de la maladie. Les variants classés à ce niveau comprennent les variants Alpha, Beta, Delta, Epsilon et Gamma, qui sont évoqués ci-dessous plus en détail.
 

Variants préoccupants

J'ai évoqué quelques mutations du SARS-CoV-2 et les stratégies de mutation virale dans une publication précédente sur le blog. Il est malgré tout essentiel de se tenir à jour, car nous en apprenons chaque jour un peu plus sur ces variants à mesure de la disponibilité de nouvelles données. Le reste de cet article portera sur les caractéristiques des variants préoccupants. Le résumé infographique des variants préoccupants du SARS-CoV-2 fourni dans le cadre de cet article présente un résumé partageable des aspects majeurs de chacun de ces variants.

Alpha

Le variant Alpha du SARS-CoV-2 a été identifié pour la première fois au Royaume-Uni fin 2020. Les mutations de la protéine spike identifiées dans le variant Alpha facilitent la fixation du virus sur les cellules hôtes. Selon les premières statistiques britanniques et les données récentes provenant des États-Unis, cette souche est 55 % plus mortelle que les autres variants du SARS-CoV-2. La bonne nouvelle est que ce variant est susceptible à notre vaccin et aux thérapies par anticorps monoclonaux. Les vaccins de Pfizer/BioNTech, AstraZeneca/Vaxzevria et Novavax/Coravax offrent une protection contre le variant Alpha. Même si le variant Alpha est actuellement la source de la plupart des nouvelles infections aux États-Unis, des études récentes suggèrent que le variant Delta se développe rapidement dans ce pays. Le variant Alpha a été identifié dans les 50 États américains et dans plus de 110 pays à travers le monde.

Bêta

Le variant Bêta du virus SARS-CoV-2 est apparu en Afrique du Sud en décembre 2020. Les mutations de la protéine spike permettent à ce variant de se lier plus étroitement aux cellules humaines. Même si les preuves de l'efficacité des vaccins contre le variant Bêta demeurent limitées, le vaccin Pfizer/BioNTech affiche une efficacité de 72%-75 % contre ce variant. Les vaccins Johnson & Johnson et Novavax/Covavax présentent une protection réduite similaire contre la maladie. En conséquence, des rappels de vaccination devront être envisagés pour développer la protection vaccinale afin d'inclure ce variant. En outre, le variant Bêta présente une susceptibilité nettement réduite aux traitements par anticorps monoclonaux : bamlanivimab et etesevimab. Le variant bêta du SARS-CoV-2 a été identifié dans 68 pays et 35 États américains.

Gamma

Le variant Gamma du SARS-CoV-2 est apparu au Brésil en octobre 2020. Le Gamma est le variant dominant en Amérique du Sud. Les mutations de ce variant aident le virus à s'attacher solidement aux cellules hôtes et à échapper à certains anticorps. Similaire au variant Bêta, le variant Gamma du SARS-CoV-2 présente une susceptibilité limitée aux traitements par anticorps. Les vaccins Moderna, Sinovac/Coronavac et Pfizer/BioNTech ont présenté une protection probable contre la maladie. Le variant gamma a été identifié dans 29 États américains et 37 pays à travers le monde. 

Delta

Le variant Delta du SARS-CoV-2 est apparu en Inde en octobre 2020. Il s'agit du variant à la croissance la plus rapide et il dépasse actuellement tous les autres variants. Ce variant contient la mutation « eek » dans la protéine spike, qui aide le virus à échapper à certains anticorps. En conséquence, le variant Delta présente un taux de transmission nettement plus élevé. Ce variant est responsable de l'augmentation spectaculaire des cas de COVID-19 en Inde au cours des derniers mois. Il a aussi été identifié dans plus de 98 pays à travers le monde au 2 juillet 2021. Les vaccins Pfizer/BioNTech (88 %) et AstraZeneca/Vaxzevria (67 %) ont démontré une protection préservée contre les cas graves provoqués par le variant Delta. Les données concernant l'efficacité des vaccins et le variant delta restent limitées.

Epsilon

Le variant Epsilon a également été appelé variant californien. En février 2021, ce variant a été identifié dans plus de la moitié des échantillons testés à Los Angeles. Il est plus contagieux que les variants précédents (alpha et bêta), mais reste largement dépassé par le variant Alpha. Le variant Epsilon comprend actuellement deux lignées : B.1.427 et B.1.429. Il présente un taux de transmission accru de 20 % et une diminution modeste de sa susceptibilité aux anticorps. Le 21 juin 2021, le variant Epsilon a quitté la catégorie des variants préoccupants.

Efficacité des vaccins contre les variants du virus SARS-CoV-2

La bonne nouvelle est que jusqu'à présent, les vaccins conservent leur efficacité contre les variants du SARS-CoV-2 susmentionnés. Même si un rappel vaccinal sera peut-être nécessaire pour lutter contre des variants particulièrement dangereux comme le variant Bêta, les vaccinations actuelles se sont avérées efficaces. Malgré l'émergence de variants et de mutations, le vaccin reste sûr et hautement efficace pour prévenir les formes graves de la maladie et les décès. Une analyse récente des données gouvernementales indique que seuls environ 150 décès sur les plus de 18 000 morts liées à la COVID-19 enregistrées jusqu'à mai concernaient des personnes entièrement vaccinées. Associée aux mesures sociales et de santé publique, notre stratégie vaccinale mondiale s'avère viable, même lorsque le SARS-CoV-2 mute pour survivre. Il faut encourager la vaccination pour avoir une chance d'éradiquer le coronavirus SARS-CoV-2 et de mettre un terme à cette pandémie mondiale.

Variants préoccupants du SARS-CoV-2

* Le tableau n'inclut pas d'informations au sujet de tous les vaccins disponibles, seulement au sujet des études spécifiques référencées. 

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